本网讯 近日，园艺学院猕猴桃基因组研究团队在国际著名期刊《Advanced Science》（中科院一区，IF=15.1）上发表了题为“Graph-based pangenome of Actinidia chinensis reveals structural variations mediating fruit degreening”的研究性论文。该研究绘制了7个单倍型T2T猕猴桃基因组，构建了首个猕猴桃属植物的泛基因组，为挖掘猕猴桃关键农艺性状的遗传基础提供了重要平台和数据。

猕猴桃是20世纪驯化最为成功的果树之一，因其富含维生素C、叶绿素等营养物质而风靡全球。猕猴桃属植物包含有54个种和75个分类单元，其中中华猕猴桃果肉颜色多变，有红肉、黄肉和绿肉三种类型。大多数中华猕猴桃在果实发育后期叶绿素快速降解，果肉呈现黄色；而‘金牌’、‘碧玉’等品种即使在果实发育后期仍然保持较高的叶绿素含量，果肉呈现绿色。

为了解析这一分子机制，该研究对7个中华猕猴桃的主要栽培品种（优系）开展了三代测序和单倍型基因组组装，同时构建了第一个猕猴桃泛基因组。基于构建的泛基因组图谱，该研究共检测到84,591个非冗余的结构变异，并重点对其中与中华猕猴桃果肉颜色（红肉、黄肉和绿肉）相关联的结构变异进行了筛选，发现了一个位于BALANCE of CHLOROPHYLL METABOLISM（AcBCM）基因启动子区域的结构变异特异存在于两个绿肉品种中。进一步研究证实，该结构变异能够导致AcBCM基因在果实发育后期的高表达，通过翻译后调控叶绿素分解代谢的关键酶Staygreen2（AcSGR2），从而阻止果实发育后期叶绿素的降解，表现出持绿表型。

猕猴桃泛基因组的构建是猕猴桃基因组学研究的重大里程碑，也是迄今第一个猕猴桃属植物的泛基因组图谱。泛基因组是一个物种内所有基因组信息的总和，相比单一参考基因组，包括了更多的遗传信息，因此可以揭示更全面的遗传变异，进一步为猕猴桃的全基因组分子设计育种与遗传改良提供重要参考。

安徽农业大学园艺学院博士生王英珍和李鹏伟为论文的第一作者，刘永胜教授、汪松虎教授和岳俊阳副教授为论文的通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金区域创新发展联合基金（安徽）和“知名专家”特聘教授等项目的资助。(图文/汪松虎 编辑/李建超 预审/陈公伟 审核/赵冠艳)

论文链接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/advs.202400322